實驗室清洗廢水經收集系統收集后首先進入調節池，調節水量、中和水質，當調節池中水量達到一定液位高度后，通過提升泵定量提升到實驗室一體化污水處理設備。

在一體化污水處理設備中首先進入酸堿中和調節系統，進行酸堿中和，在此通過pH控制儀，利用計量泵準確投加一定量NaOH水溶液，調節pH值至8～9之間，在堿性條件下，廢水中的酸被中和，廢水中若含有鐵、鎘、銅、錳、鎳、鉛、鉻等重金屬離子則可與OH-發生化學反應生成氫氧化物沉淀。

酸堿中和池出水接著流入絮凝沉淀池，酸堿中和后產生的沉淀以及污水中其他懸浮物在沉淀池中通過泥水間的異向流動實現污泥與水的分離。

沉淀池后的廢水最后進入多介質過濾器，尚未被去除的細小懸浮物、微量金屬及極少量的有機物等，一部分通過學校實驗室廢水處理設備石英砂以及具有巨大孔隙結構和比表面積的活性炭的吸咐、截留等物理、化學作用等去除，另一部則被附著在活性炭上的微生物膜中的厭氧、好氧及兼性菌等降解去除，活性炭截留吸咐，與微生物降解解吸的過程穿插、交替、循環進行。至此廢水即可達標排放。